Category: Python
Mask R-CNN을 이용한 고막 검출 연구 (The semantic segmentation approach for normal and pathologic tympanic membrane using deep learning)
On January 9, 2019 by JG SeokbioRxiv 링크: https://www.biorxiv.org/content/early/2019/01/10/515007 위 연구는 2018년 10월 대한이비인후과학회 학술대회에서 처음 발표했습니다. 11월 중순 부터 투고를 진행했으나 두어차례 reject이 되면서 시간이 너무 지체되는 것 같아 preprint form으로 먼저 업로드하였습니다. 빠르게 최신 모델이 발표되는 가운데, 그 속도를 따라잡지 못하는 개인 연구자들은 아무래도 ‘어떻게 내가 갖고 있는 데이터를 적용시켜 결과를 얻을 수 있을까?’ 가 중요한 문제인 것
4. Cocoapi setup @ python 3.5
On April 6, 2018 by JG SeokStackoverflow를 보면 python3에서는 작동이 안된다고들 하는데, 어쩌다보니 실행이 되는 듯해서 기록에 남긴다. 1. pip에서 git를 이용하기 위해 git를 설치 (base) > conda install -c anaconda git 2. Visual Studio 2017용 Build Tool을 여기서 찾아서 다운로드 받는다. (https://www.visualstudio.com/ko/downloads/?rr=http%3A%2F%2Flandinghub.visualstudio.com%2Fvisual-cpp-build-tools) 3. cocoapi Python 버전 설치: https://github.com/philferriere/cocoapi (env) > pip install git+https://github.com/philferriere/cocoapi.git#subdirectory=PythonAPI 명령어로 진행, 디펜던시 오류가 나는
3. 한 단계를 넘어간다.
On March 21, 2018 by JG Seok참 해보고나면 별거 아니지만, 시행착오가 많다. (1) Class activation map (2) 그리고 이것을 뽑아내기 위해 마지막 convolution layer를 통과한 결과와 마지막 FCN을 통한 계산. 좌측은 성대로 판별된 사진이고 우측은 그렇지 않은 사진 우측에도 성대로 추정할 수 있는 부위가 있으나, 그 부분의 level이 낮게 나옴으로써 대칭적인 결과를 확인할 수 있었다.
Visualizing Keras Model: ImportError 에러 해결방법
On March 14, 2018 by JG SeokReference : http://www.codesofinterest.com/2017/02/visualizing-model-structures-in-keras.html 윈도우 + 아나콘다 + Keras 사용시 모델을 Visualize 할 때 발생하는 에러에 대한 해결책. 원래 간단하게는 pip install pydot pip install graphviz 를 설치한 뒤에 from keras.utils.visualize_util import plot plot(model, to_file=’model.png’) 하면되나, ImportError가 발생해버린다. 이를 해결하기 위해서는, pydot은 pip로 설치하고, graphviz는 공식 사이트(https://www.graphviz.org/ )에서 윈도우 설치판을 다운받도록 하고 설치한다. (설치경로
2. Anaconda Tensorflow GPU 버전 설치 (2019.4 수정)
On March 8, 2018 by JG SeokReference : https://medium.com/@hussnainfareed/setup-an-environment-for-machine-learning-and-deep-learning-with-anaconda-in-windows-5d7134a3db10 GPU: 2018. 3월에는 1080ti, 2019년 4월에는 Titan V 였습니다. 0. Visual Studio 설치 (2019.4 추가) CUDA 9.0에서는 어떤 버전까지 지원했는지를 모르겠지만, CUDA 10.0으로 다시 설치하다보니, Visual Studio IDE를 설치해야 CUDA가 설치가 되는데, 최신버전은 Visual Studio 2019이나, 이 경우 CUDA 10에서 인식을 못해, 설치시 ‘Not compatible’이라는 경고창이 뜬다. https://www.visualstudio.com/ko-kr/downloads/download-visual-studio-vs 이 페이지 아래로 조금만
1. 맥북으로는 어림없다.
On March 5, 2018 by JG Seok<오늘의 실험> 무려! 딥러닝 수준에 다가가지도 못하는 몇년전의 LeNet-5 모델을 이용해 한번 작업을 구성하였다. 단순 성대 검출모델로서 라벨링된 이미지를 1, 안된 이미지를 0 으로 잡고. C1 : 440,440,1 (channel) > 220,220,6 S2 : 220,220,6 > 110,110,6 (Maxpooling) C3 : 110,110,6 > 110,110,16 S4 : 110,110,16 > 55,55,16 FCN5 : 55x55x16 > 128 FCN6 : 128
0. 프로젝트 진행상황 (정리중)
On March 4, 2018 by JG Seok1. 한쪽으로는 데이터셋(Data set) 늘리기, 한쪽으로는 알고리즘 짜는 두가지 트렉으로 진행 중. 부족한 시간을 확보하기 위해 근무 사이사이에 데이터셋을 준비한다. – 영상에서 Target image labeling – 수술 전, 후의 음성 파일 2. nVidia GTX 1060, 정격전압 700W짜리 파워서플라이 새로 구입 1. 동영상에서 프레임 추출 2. 이미지 회색으로 바꾸기, 라벨링 데이터 포함 3. ROI 설정
맥(Mac)에서 이해하는 도커(Docker) #2. Hyperledger Sawtooth 연결까지
On February 8, 2018 by JG Seokhttps://steemit.com/kr/@junn/mac-docker-1 에 이은 Mac에서 Docker 이해하기 2탄입니다. 이번 포스팅은 다음 순서로 진행됩니다. (1) ubuntu만 설치된 image에 python을 설치한 새로운 이미지를 만들어보고, 차이를 확인보는 것. (2) python 실행이 바로되는 컨테이너 만들기 (이미지를 단일 실행파일 처럼 사용) (3) Sawtooth-shell에 Django를 설치한 이미지 만들기 (4) Django 서버를 통해 sawtooth blockchain 출력하기 (Sawtooth가 만들어낸 genesis block을 출력한 화면은 아래와 같습니다.
Mediteam.us 개발 – Python & Selenium을 이용한 구글검색 크롤링
On January 13, 2018 by JG Seok‘관련글 검색’ 기능을 넣기 위한 시행착오 끝에 마지막으로 생각해낸 방식이 바로 사이트 내부의 구글 검색엔진을 이용하는 방법이었다. 핵심 키워드를 구하고, 그것을 검색창에 넣어 값을 가져오면 쉽게 가능할 것 같았다. 그리고 주기적으로 전체를 갱신해준다면, 그 값도 점점 최신이 될 것이라고 판단. 이를 위해 필요한 라이브러리가 바로 Selenium 이라는 것이다. 이전 포스팅에서도 소개했었지만, 이 책을 슥 읽어보면
Mediteam.us 개발 – 이 글은 어느 나라 말로 적혀있는 문서인가? (한글, 영어, 일본어 형태소 분석)
On January 9, 2018 by JG Seok‘내가 왜 이걸 하고 있지?’ 시리즈도 막바지입니다. ‘관련글 찾기’ 별거 아닌데, 너무 복잡합니다. 이렇게 꼭 해야하나…다른 좋은 방법 있으면 알려주세요 ㅠ 이번 포스팅은 아래 3개의 이전 포스팅에 이은 내용들입니다. 1) 관련글 찾기 (TF-IDF, konlpy) (https://junn.net/archives/1923) 2) nodeJS와 python 상호 간 통신(using python-shell, synchronize) (https://junn.net/archives/1978) 3) Mecab (Python library)를 이용한 일본어, 한글 형태소 분석 (https://junn.net/archives/category/programming) Github
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![[번역글] Image Segmentation에 대한 짧은 이야기: R-CNN 에서 부터 Mask R-CNN 까지](https://i2.wp.com/junn.net/wp-content/uploads/2018/04/4.png?resize=40%2C40&ssl=1){kind=small}
![[R] anaconda를 이용한 R package 설치](https://i1.wp.com/junn.net/wp-content/uploads/2019/04/스크린샷-2019-04-07-오후-5.22.02.png?resize=40%2C40&ssl=1){kind=small}
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