[R] Jupyter를 이용한 R 통계 세팅 (2022.10 기준)

거의 1년간 논문을 제대로 쓰지 않다가 다시 손대보려고 하면서 업데이트.

 

Anaconda3 설치 시에 전체사용자용이 아닌 Just for me로 진행하는게 좋은 듯 함. (R이랑은 조금 무관하나 전체 사용자용으로 하면 종종 pip 설치시 권한문제가 발생하는 듯 하다)

 

Step 1. Conda 업데이트

conda update -n base conda

 

Step 2. 환경 생성 (이름은 rconda라고 지음)

conda create -n rconda r-base

 

Step 3. 설치가 필요한 라이브러리 r-irkernel, jupyter, jupyterlab

Step 3-1. 백신 프로그램의 firewall 때문인지 언제부터인지 모르게 생성된 환경을 activation시키는 경우 conda 명령어시 SSL 에러가 발생, 따라서 base에서 rconda 환경에 설치를 진행하는 것 처럼해서 진행한다. 아래 두줄의 결과가 동일하다.

(base) conda install -n rconda -c r r-irkernel
(rconda) conda install -n rconda -c r r-irkernel

 

Step 3-2. 동일하게 Jupyter 설치, Jupyterlab도

conda install -n rconda -c anaconda jupyter 
conda install -n rconda -c conda-forge jupyterlab

 

Step 4. 실행해보자

아래와 같이 R이 Notebook 메뉴에 뜬다.

 

Step 5. 자주 썼던 추가 패키지 설치

conda install -n rconda -c conda-forge r-openxlsx r-dendextend r-dplyr r-envstats r-survminer r-segmented
conda install -n rconda -c bioconda r-psych r-openxlsx 
conda install -n rconda -c r r-gplots

문제 없는 것 확인


간단한 통계 진행

[R] 간단한 통계 과정 목록 (엑셀 xlsx 불러오기 부터)

 

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